51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3227 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 333 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  79.58 
 
 		 333 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  39.46 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.63 
 
 		 327 aa  248  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.44 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2179  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209398  hitchhiker  0.000230453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  24.48 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.69 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  27.35 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  26.34 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  29.1 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  26.46 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  23.95 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  22.77 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 322 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.41 
 
 		 722 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.66 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.67 
 
 		 754 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  24 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  23.66 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  24.36 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1074 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  45.71 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  22.83 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  23.36 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  25.79 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  25.79 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  25.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  25.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  25.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  25.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  25.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  25.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  25.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  25.42 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>