249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1638 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
322 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  32.56 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
297 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  34.69 
 
 
313 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  36.68 
 
 
315 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  33.06 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  34.43 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
332 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  37.28 
 
 
615 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  39.3 
 
 
633 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
303 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  29.12 
 
 
300 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 
323 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  34.5 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  28.63 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
302 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  25.62 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
299 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
306 aa  85.9  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
489 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.73 
 
 
754 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1377  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.14 
 
 
284 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 
722 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  42.73 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  30.04 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.12 
 
 
379 aa  60.1  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.11 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
340 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.63 
 
 
327 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  28.1 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  37.14 
 
 
954 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  27.1 
 
 
301 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  23.89 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
358 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  36.7 
 
 
997 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  37.68 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  36.28 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  26.09 
 
 
652 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4321  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
476 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 
341 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
387 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.13 
 
 
302 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  28.2 
 
 
313 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
312 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
337 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  40.24 
 
 
331 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
329 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  30.49 
 
 
304 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.33 
 
 
295 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  40.24 
 
 
342 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 
705 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 
841 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
714 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0130  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0102341  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>