More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3890 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 633 aa  1231    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  52.49 
 
 		 615 aa  472  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  58.67 
 
 		 306 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  60.67 
 
 		 315 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  62.91 
 
 		 296 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  54.49 
 
 		 313 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  50.15 
 
 		 334 aa  252  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  42.86 
 
 		 291 aa  205  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  43.61 
 
 		 280 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  42.38 
 
 		 282 aa  195  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1773  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 272 aa  190  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.61614  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 		 297 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  40.23 
 
 		 292 aa  181  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 		 271 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  39.06 
 
 		 293 aa  164  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 		 279 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 		 270 aa  148  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 273 aa  144  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01936  putative glycosyltransferase WbbD  30.71 
 
 		 255 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01923  hypothetical protein  30.71 
 
 		 255 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 322 aa  140  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  33.56 
 
 		 322 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  30.68 
 
 		 306 aa  125  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 		 332 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  30.51 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3046  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 		 271 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 		 299 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 303 aa  104  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 274 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01491  hypothetical protein  28.41 
 
 		 296 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 302 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 		 352 aa  97.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 306 aa  96.3  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 328 aa  94  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  25.9 
 
 		 273 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 356 aa  90.5  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.93 
 
 		 341 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  29.35 
 
 		 337 aa  89.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  30.16 
 
 		 258 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 336 aa  87.4  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 361 aa  87  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 336 aa  87  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03054  glycosyltransferase  30.94 
 
 		 295 aa  87  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 322 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 338 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 347 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  29.11 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 283 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  30.94 
 
 		 320 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 		 323 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 305 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  34.32 
 
 		 334 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 334 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 		 267 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  28.51 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.02 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2832  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0389241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.87 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  24.76 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 280 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 367 aa  72  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 		 353 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2021  family 2 glycosyl transferase  33.19 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  29.05 
 
 		 297 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  29.05 
 
 		 297 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  22.73 
 
 		 304 aa  69.3  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 1250 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 1032 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 1177 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>