More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2832 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2832  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0389241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1773  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.61614  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.39 
 
 		 367 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.96 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  27.39 
 
 		 332 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 364 aa  85.9  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 1250 aa  85.9  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2021  family 2 glycosyl transferase  28.37 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 633 aa  75.5  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.37 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  24.48 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  23.96 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  21.8 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01936  putative glycosyltransferase WbbD  29.69 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01923  hypothetical protein  29.69 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 		 361 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2388  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.416344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  25.35 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.88 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  23.18 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  26.03 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  23.32 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.9 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.62 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  24.76 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.81 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.81 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  24.81 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  27.78 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 584 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  22.48 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  21.38 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.89 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.73 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  27.45 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  24 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 		 689 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>