295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0628 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  41.03 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  39.85 
 
 
270 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1773  glycosyl transferase family 2  38.87 
 
 
272 aa  200  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.61614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  43.61 
 
 
633 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  41.2 
 
 
306 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  46.39 
 
 
615 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  38.17 
 
 
273 aa  175  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0969327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01936  putative glycosyltransferase WbbD  36.99 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01923  hypothetical protein  36.99 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  39.53 
 
 
291 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  39.93 
 
 
296 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3046  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
271 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
279 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
274 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01491  hypothetical protein  31.64 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.76 
 
 
330 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 
338 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  30.84 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.96 
 
 
349 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
333 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.87 
 
 
341 aa  89.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
283 aa  89  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
347 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
340 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03054  glycosyltransferase  28.35 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  28.15 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.09 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  28.57 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  35.12 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
1250 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 
356 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2832  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0389241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2620  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3145  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.14 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2499  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0714  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.14 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2193  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.9 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2066  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.14 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3085  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.14 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3122  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.14 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541657  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2548  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.14 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.86 
 
 
278 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0511045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2269  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0781  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0918  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3703  putative glycosyl transferase  30 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0770  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.8 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.6 
 
 
340 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  22.81 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2021  family 2 glycosyl transferase  29.94 
 
 
266 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
663 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3988  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
274 aa  62  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
1032 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.07 
 
 
466 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 
335 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.76 
 
 
317 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>