More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3460 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
330 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  66.57 
 
 
336 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  64.85 
 
 
339 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  65.35 
 
 
338 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  43.9 
 
 
336 aa  255  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  48.34 
 
 
334 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  46.53 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  46.22 
 
 
334 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  47.88 
 
 
334 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  41.62 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 
340 aa  232  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  41.42 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.65 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2620  glycosyl transferase family 2  40.79 
 
 
337 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  40.24 
 
 
344 aa  205  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  39.82 
 
 
341 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
356 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  43.78 
 
 
347 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  43.26 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  38.03 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
365 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
306 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  33.67 
 
 
332 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.42 
 
 
367 aa  123  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
1250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  40.47 
 
 
353 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.83 
 
 
341 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
277 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.72 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  32.54 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
336 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 
334 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
330 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
321 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
321 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
274 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
270 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 
280 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
308 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
367 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2728  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
286 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
663 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
364 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
373 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
273 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
262 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  38.42 
 
 
364 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
398 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
384 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 
1739 aa  99.4  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
304 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
376 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
1035 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
347 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
1032 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
689 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.47 
 
 
294 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
341 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.16 
 
 
312 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
373 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.16 
 
 
294 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1773  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
272 aa  93.2  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.61614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
299 aa  92.8  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
338 aa  92.8  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3046  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
271 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
581 aa  91.3  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
279 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  25.81 
 
 
272 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  30.41 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  35.85 
 
 
291 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
330 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
349 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
357 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
318 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  35.81 
 
 
296 aa  89.4  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
235 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.91 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  30.17 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
274 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>