More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1022 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03054  glycosyltransferase  33.46 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  34.4 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 347 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 361 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.09 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1773  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.61614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 365 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 		 352 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 321 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  26.88 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  30.84 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 336 aa  96.3  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01936  putative glycosyltransferase WbbD  28.46 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01923  hypothetical protein  28.46 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.41 
 
 		 341 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 347 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 		 306 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 341 aa  92.4  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 342 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 633 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 338 aa  88.6  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 339 aa  88.6  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 351 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 663 aa  85.9  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  26.84 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3046  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.79 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 1250 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.19 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.11 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2728  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2021  family 2 glycosyl transferase  29.13 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  25.71 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 		 334 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2269  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0781  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  25.78 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0770  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  21.46 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 1035 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 		 777 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.69 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  21.81 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  22.67 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01491  hypothetical protein  21.56 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  20.98 
 
 		 727 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  23.96 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>