129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3206 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  100 
 
 		 258 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03054  glycosyltransferase  57.2 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  34.4 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1773  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.61614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.79 
 
 		 377 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 		 633 aa  89  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 361 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  28.64 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 334 aa  85.5  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.32 
 
 		 367 aa  82  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2021  family 2 glycosyl transferase  28.21 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.77 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 		 1250 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  23.24 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  24.63 
 
 		 663 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01491  hypothetical protein  26.53 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.79 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3046  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 727 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  27.03 
 
 		 296 aa  62  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2832  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0389241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  25.52 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 334 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01936  putative glycosyltransferase WbbD  25.6 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01923  hypothetical protein  25.6 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 1035 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2728  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 		 364 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  24.86 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 		 336 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 660 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.61 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 341 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  22.68 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 		 347 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 364 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 655 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2269  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 		 384 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  23.66 
 
 		 340 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 334 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  22.88 
 
 		 333 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3703  putative glycosyl transferase  22.94 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0918  glycosyl transferase family 2  22.35 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 		 344 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  25.45 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  21.8 
 
 		 344 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 356 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  18.78 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2499  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  22.67 
 
 		 1991 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>