More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0130 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0130  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
352 aa  717    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0102341  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0524  glycosyl transferase family protein  57.88 
 
 
346 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
334 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
841 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
337 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
314 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
324 aa  92.8  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
294 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
313 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
331 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
318 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
1340 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
714 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
331 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
705 aa  86.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
343 aa  85.9  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.46 
 
 
2401 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  28.79 
 
 
320 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.67 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
476 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
1162 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
1739 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  23.13 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  42.06 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0722  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
472 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.693159 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
1523 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  43.14 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
1106 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
679 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  24.68 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  23.3 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  40.43 
 
 
652 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  36.27 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  23.3 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
624 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 
691 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
703 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
836 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
683 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  34.57 
 
 
691 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
1523 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  35.79 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
691 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  29.47 
 
 
274 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
841 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>