More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3682 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 330 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  80 
 
 		 332 aa  528  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  60.87 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  48.78 
 
 		 331 aa  295  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  41.89 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 		 318 aa  196  7e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  36.16 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  28.16 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  33.24 
 
 		 378 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  36.64 
 
 		 838 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 841 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 341 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  33.72 
 
 		 822 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32.83 
 
 		 841 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  36.78 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  36.71 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  31.03 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 279 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0059  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 401 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28.46 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  38.55 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 836 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  27.81 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  27.48 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 		 1340 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  33.77 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 		 298 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 		 307 aa  99.4  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 		 430 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 		 616 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  30.39 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  30.61 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1523 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  26.8 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 376 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 		 337 aa  95.9  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0513  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 355 aa  95.9  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.0426124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 358 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  22.09 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 1268 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 		 288 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  24.01 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 308 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 300 aa  93.6  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  28.32 
 
 		 652 aa  92.8  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  34.11 
 
 		 284 aa  92.4  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>