More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3720 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  100 
 
 
302 aa  631  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  61.09 
 
 
319 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  39.31 
 
 
297 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2894  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6266  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
321 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
346 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
307 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
303 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  34.32 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
300 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
305 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
311 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
279 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
722 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
286 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
291 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
282 aa  99  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 
342 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  27.8 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
455 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  30.31 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
341 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  27.63 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  26.27 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  28.33 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.69 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  31.4 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
970 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  23.86 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.83 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1763  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.59071  normal  0.044278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  24.05 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.76 
 
 
2401 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  27.02 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  27.34 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  26.61 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  24.4 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
1267 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  25.95 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  21.32 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2402  hypothetical protein  29.02 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0722  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
472 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.693159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
330 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
489 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  25 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
841 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
841 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  26.56 
 
 
652 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>