More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3595 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
331 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  58.84 
 
 
296 aa  328  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  59.8 
 
 
299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  51.62 
 
 
307 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.82 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.82 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.82 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.82 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.82 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.82 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  51.26 
 
 
307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.46 
 
 
295 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  47.62 
 
 
291 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  48.19 
 
 
307 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5448  glycosyl transferase family protein  51.81 
 
 
308 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  47.54 
 
 
287 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  47.54 
 
 
287 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  48.94 
 
 
292 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  45.96 
 
 
327 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1578  glycosyl transferase family 2  53.17 
 
 
291 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  49.01 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  49.01 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  53.38 
 
 
299 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
289 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  44.11 
 
 
264 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  42.4 
 
 
290 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
841 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  26.38 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  29.6 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3343  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178674  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
822 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  33.55 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.15 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3732  glycosyltransferase-like protein  29.52 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  0.0274925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
421 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  24.79 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
836 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
672 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  40.45 
 
 
1225 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
233 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  31.64 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  27.54 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  33.47 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  22.78 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  22.78 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  28.91 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
1035 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  26.32 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>