120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2264 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
296 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  59.6 
 
 
297 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  59.6 
 
 
297 aa  358  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  59.26 
 
 
297 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  32.87 
 
 
320 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  32.82 
 
 
322 aa  96.3  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  31.22 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  29.41 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  31.31 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  26.34 
 
 
754 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  28.16 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  36 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
822 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  22.04 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.86 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.86 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.86 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.86 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.86 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.86 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.05 
 
 
295 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4831  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
294 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0419  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  23.44 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
489 aa  52.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 
329 aa  52  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  27.44 
 
 
451 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  25 
 
 
323 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.53 
 
 
2401 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  25.46 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
616 aa  49.7  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  22.93 
 
 
838 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6266  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
288 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
455 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 
337 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  24.2 
 
 
292 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  36.49 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  36.49 
 
 
421 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  36.49 
 
 
421 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  22.95 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  22.95 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
336 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0454  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797965  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  22.51 
 
 
360 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
227 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  30.83 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  22.62 
 
 
358 aa  45.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 
297 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  20.37 
 
 
319 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  21.58 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  21.16 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
391 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.7 
 
 
441 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
441 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  21.22 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  21.88 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.7 
 
 
441 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.7 
 
 
441 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.7 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.7 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  20.78 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.7 
 
 
441 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  21.48 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  22.97 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  18.52 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
624 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14420  glycosyl transferase  40.32 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  31.75 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.47 
 
 
442 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 
499 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  22.34 
 
 
1267 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>