193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6266 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6266  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
288 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 
319 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  35.57 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2894  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
300 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
305 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
302 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
321 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
305 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  29.62 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
298 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
290 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.59 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
455 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
303 aa  82  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  29.35 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
489 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
337 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  26.79 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
722 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
1267 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
1267 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  25.1 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  25.5 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.89 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
841 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
330 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
703 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  25.67 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  25.62 
 
 
1837 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  22.33 
 
 
318 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
557 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  24.46 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
1106 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
616 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
602 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
817 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
319 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
994 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  23.45 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 
324 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  21.77 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
346 aa  56.2  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  23.76 
 
 
315 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  21.01 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  21.69 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  25.09 
 
 
838 aa  55.8  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  25 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  24.14 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
330 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
705 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  23.58 
 
 
652 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  22.78 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  23.2 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
822 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  24.51 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
337 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  21.78 
 
 
308 aa  52.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
1077 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  24.67 
 
 
320 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.83 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
775 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
1340 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1467  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0153271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>