More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_14420  glycosyl transferase  100 
 
 
297 aa  616  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14340  glycosyl transferase  40 
 
 
334 aa  236  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.049035  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1293  ribonuclease III  39.18 
 
 
323 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3999  ribonuclease III  38.57 
 
 
312 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329271  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0939  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3309  glycosyl transferase family 2  35.03 
 
 
317 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4279  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
333 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0291  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
312 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3414  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 
306 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3121  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
315 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0465511  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
320 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
366 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3259  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  29.2 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
327 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.02 
 
 
326 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
364 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
341 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
340 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  27.76 
 
 
330 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.59 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  28.15 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.58 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  27.4 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.4 
 
 
323 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  26.58 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
351 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.58 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.58 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  26.58 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.58 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.05 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.05 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.43 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.05 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  27.05 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0725  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.367599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
336 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  30.21 
 
 
347 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
337 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
350 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.56 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.56 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.56 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.56 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.1 
 
 
327 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.1 
 
 
327 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
331 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
350 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 
333 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  28.18 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
323 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.24 
 
 
327 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
340 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
345 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4680  Ribonuclease III  27.54 
 
 
316 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
345 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
345 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
312 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  26.76 
 
 
319 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
326 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.9 
 
 
327 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.9 
 
 
327 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  28.17 
 
 
320 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.9 
 
 
327 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.9 
 
 
327 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
334 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  29.2 
 
 
348 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2999  b-glycosyltransferase  29.52 
 
 
310 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.221731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
322 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  27.68 
 
 
308 aa  122  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
349 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 
319 aa  122  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  29.26 
 
 
367 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.57 
 
 
308 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
324 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  26.26 
 
 
346 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
320 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4081  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.869722  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>