More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6128 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  100 
 
 		 367 aa  743    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  70.03 
 
 		 373 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  70.03 
 
 		 373 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  55.52 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  47.87 
 
 		 346 aa  345  8e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  53.31 
 
 		 335 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  52.82 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  51.58 
 
 		 330 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  54.33 
 
 		 348 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  51.9 
 
 		 330 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  49.54 
 
 		 337 aa  332  9e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  55.15 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  49.53 
 
 		 334 aa  329  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  49.53 
 
 		 320 aa  328  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  48.57 
 
 		 339 aa  326  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  50.66 
 
 		 341 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.03 
 
 		 332 aa  323  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  47.53 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  47.63 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  51.51 
 
 		 350 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  48.06 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  51.44 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  48.84 
 
 		 330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  48.84 
 
 		 330 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  43.87 
 
 		 312 aa  305  9.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  49.19 
 
 		 324 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  49.84 
 
 		 324 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  49.33 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  50.33 
 
 		 338 aa  302  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.89 
 
 		 323 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  43.89 
 
 		 323 aa  299  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.89 
 
 		 323 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  43.89 
 
 		 323 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  47.02 
 
 		 331 aa  299  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  49 
 
 		 357 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  49.33 
 
 		 335 aa  299  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  50.16 
 
 		 334 aa  298  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  45.33 
 
 		 310 aa  298  8e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  44.82 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  44.82 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  43.56 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  44.09 
 
 		 358 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  43.8 
 
 		 358 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  48.83 
 
 		 319 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  49.67 
 
 		 345 aa  295  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  43.97 
 
 		 319 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  44.54 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  44.34 
 
 		 319 aa  288  9e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.33 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  47.16 
 
 		 306 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  47.62 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.33 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.33 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.33 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  46.67 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  48 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  48.67 
 
 		 347 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  48.67 
 
 		 347 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  43.38 
 
 		 320 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  46.53 
 
 		 337 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  44.01 
 
 		 319 aa  285  9e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  47 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  46.15 
 
 		 308 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  43.37 
 
 		 322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  47.67 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  43.15 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  46.05 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  42.33 
 
 		 320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  46.25 
 
 		 347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  46.15 
 
 		 306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 		 332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  49.16 
 
 		 383 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  44.82 
 
 		 311 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  44.82 
 
 		 311 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  45.48 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  43.67 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  45.48 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  45.82 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  43.67 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  46.15 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  47.33 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  45.82 
 
 		 310 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  46.62 
 
 		 312 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  47.33 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  47.33 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  47.33 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  44.48 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  46.73 
 
 		 350 aa  275  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4719  glycosyl transferase family protein  46.47 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1339  glycosyl transferase family 2  44.1 
 
 		 347 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  45.51 
 
 		 339 aa  272  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  42.14 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  43.81 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4543  bactoprenol glucosyl transferase  47.16 
 
 		 309 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  47.67 
 
 		 339 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  47.16 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>