More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1293 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1293  ribonuclease III  100 
 
 		 323 aa  662    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3414  glycosyl transferase family 2  43.89 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14340  glycosyl transferase  40.58 
 
 		 334 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.049035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4279  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0291  glycosyl transferase family 2  40.86 
 
 		 312 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0939  glycosyl transferase family 2  40.39 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3999  ribonuclease III  40.26 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3309  glycosyl transferase family 2  39.67 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14420  glycosyl transferase  39.18 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3121  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0465511  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0725  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.367599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3259  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 320 aa  182  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  30.19 
 
 		 346 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.7 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.91 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.39 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  30.25 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.76 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 347 aa  165  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  30.62 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.87 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  33.55 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  31.27 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.84 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  33.55 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  31.07 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6493  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  31.07 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  29.21 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  29.6 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  32.25 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  32.92 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.97 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  30.52 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  30.94 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  30.94 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.26 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  28.53 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  31.37 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.26 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  30.26 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.65 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  31.89 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.71 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.26 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.65 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.65 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.26 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  30.26 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  29.41 
 
 		 306 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.26 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 366 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  29.49 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  29.97 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  30.03 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.49 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 		 338 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  29.97 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.94 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.94 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.94 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.94 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.94 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.94 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.94 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.94 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>