More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1307 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  100 
 
 		 306 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  89.22 
 
 		 306 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  88.56 
 
 		 308 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  88.89 
 
 		 308 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  89.22 
 
 		 308 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  89.11 
 
 		 306 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  88.12 
 
 		 310 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  87.79 
 
 		 310 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4458  bactoprenol glucosyl transferase  80.33 
 
 		 309 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  80.33 
 
 		 309 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4543  bactoprenol glucosyl transferase  80 
 
 		 309 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0642  putative glycosyl transferase  75.58 
 
 		 304 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  69.74 
 
 		 319 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  58.59 
 
 		 312 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  53.44 
 
 		 327 aa  350  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  55.63 
 
 		 357 aa  348  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  53.31 
 
 		 365 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  53.31 
 
 		 365 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  53.31 
 
 		 365 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  53.97 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  55.63 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  52.98 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  53.31 
 
 		 358 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  54.97 
 
 		 353 aa  341  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  54.97 
 
 		 338 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  53.59 
 
 		 340 aa  338  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  55.3 
 
 		 340 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.3 
 
 		 353 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.3 
 
 		 353 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.3 
 
 		 353 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  52.16 
 
 		 319 aa  331  9e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  55.96 
 
 		 337 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  54.97 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  54.97 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  54.97 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  54.64 
 
 		 347 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  52.12 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  54.64 
 
 		 347 aa  318  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  54.97 
 
 		 348 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  51.68 
 
 		 319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  49.02 
 
 		 347 aa  310  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  50.33 
 
 		 342 aa  305  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  46.71 
 
 		 320 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  48.36 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  47.02 
 
 		 346 aa  295  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  47.51 
 
 		 383 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  46.84 
 
 		 334 aa  295  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  46.36 
 
 		 350 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  47.39 
 
 		 330 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  46.38 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  45.48 
 
 		 367 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.03 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  47.51 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  43 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  43.19 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  41.53 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  45.33 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  43 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  47.16 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0162  putative glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  44.26 
 
 		 343 aa  269  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  44.22 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  46.53 
 
 		 345 aa  269  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  45.48 
 
 		 335 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0192  putative glycosyl transferase family protein  44.95 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  46.49 
 
 		 319 aa  265  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  42.19 
 
 		 343 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  46.51 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  46.51 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  43.56 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  43.52 
 
 		 333 aa  258  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  43.89 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 		 339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  42.67 
 
 		 312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  42.62 
 
 		 336 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  41.25 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25741  glycosyl transferase family protein  42.36 
 
 		 324 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  41.91 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  43.05 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.92 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  41.06 
 
 		 339 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  43.14 
 
 		 312 aa  248  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  40.78 
 
 		 332 aa  248  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  42.48 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 		 339 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0744  glycosyl transferase family protein  42.21 
 
 		 327 aa  245  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0728  glycosyl transferase family protein  42.21 
 
 		 327 aa  245  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1389  glycosyl transferase  43.32 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.776961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  43.09 
 
 		 341 aa  245  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  40.33 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  43 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  43 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  43 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  43 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  40.51 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  40.07 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>