More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3414 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3414  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 306 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0291  glycosyl transferase family 2  60.07 
 
 		 312 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1293  ribonuclease III  43.89 
 
 		 323 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4279  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 		 333 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0939  glycosyl transferase family 2  41.58 
 
 		 317 aa  245  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3309  glycosyl transferase family 2  42.24 
 
 		 317 aa  245  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3999  ribonuclease III  39.33 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14340  glycosyl transferase  38.94 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.049035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14420  glycosyl transferase  35.94 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3121  glycosyl transferase family protein  34.97 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0465511  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.2 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.44 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.11 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  31.37 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3259  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.58 
 
 		 327 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.76 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.76 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  31.76 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.76 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  31.76 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.76 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.55 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0725  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.367599  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.29 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.97 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.97 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.97 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.97 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  31.7 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  31.46 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  31.35 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  29.84 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  31.05 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.12 
 
 		 327 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6493  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.48 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  28.48 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 		 333 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.8 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.8 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.8 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.8 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.8 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.8 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.8 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.8 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  27.81 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 345 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.52 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 311 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 342 aa  138  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 311 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  30.16 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  28.25 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  27.96 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  27.69 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.14 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  29.84 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  28.48 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>