More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0334 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
319 aa  659    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  55.16 
 
 
312 aa  363  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  50.79 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  51.32 
 
 
330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  51.3 
 
 
330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.55 
 
 
323 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  48.55 
 
 
323 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  48.55 
 
 
323 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.55 
 
 
323 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  48.87 
 
 
323 aa  322  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  46.1 
 
 
324 aa  315  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  48.84 
 
 
320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  48.83 
 
 
320 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  48.55 
 
 
336 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  46 
 
 
310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  47.19 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  44.88 
 
 
321 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  49.17 
 
 
311 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  49.17 
 
 
311 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  46.69 
 
 
333 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  46.18 
 
 
327 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  44.37 
 
 
322 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  46.6 
 
 
356 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  45.33 
 
 
367 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  46.51 
 
 
366 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  44.41 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  44.37 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  45.21 
 
 
330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  45.21 
 
 
330 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  45.33 
 
 
364 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  41.81 
 
 
346 aa  275  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  45.33 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  45.64 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 
339 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  43.28 
 
 
319 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 
347 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 
335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  43.23 
 
 
331 aa  267  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  45.6 
 
 
350 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  41.31 
 
 
343 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
312 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  43.23 
 
 
373 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  41.97 
 
 
351 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  43.23 
 
 
373 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
331 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  38.87 
 
 
319 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
339 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  42.67 
 
 
352 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  42.38 
 
 
339 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  38.34 
 
 
319 aa  255  7e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  39.4 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0387  Ribonuclease III  41.32 
 
 
315 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  39.67 
 
 
312 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  38.36 
 
 
314 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  40.97 
 
 
332 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 
334 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 
339 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 
345 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  40.53 
 
 
319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2952  glycosyl transferase family 2  43.28 
 
 
305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23402  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.86 
 
 
332 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3180  glycosyl transferase family 2  43.87 
 
 
329 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  40.8 
 
 
324 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 
343 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
340 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 
340 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4719  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 
346 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19129  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 
327 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
383 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 
342 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  38 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 
338 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 
357 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.16 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  36.42 
 
 
324 aa  232  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  37.7 
 
 
308 aa  230  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
347 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.1 
 
 
324 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
339 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 
320 aa  228  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 
360 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 
323 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  38.46 
 
 
324 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0218  glycosyltransferase-like protein  40.32 
 
 
330 aa  227  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0486  glycosyltransferase-like protein  40.32 
 
 
330 aa  227  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.518012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  38.64 
 
 
312 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  37.17 
 
 
353 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2344  glycosyl transferase family 2  40.51 
 
 
340 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  37.03 
 
 
358 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  37.05 
 
 
312 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1941  Ribonuclease III  41.69 
 
 
343 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 
358 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
334 aa  225  7e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
312 aa  225  8e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 
336 aa  225  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0613  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
332 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.258074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>