More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2344 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2344  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
340 aa  697    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1941  Ribonuclease III  77.84 
 
 
343 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3180  glycosyl transferase family 2  66.04 
 
 
329 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0387  Ribonuclease III  60.71 
 
 
315 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0218  glycosyltransferase-like protein  55.66 
 
 
330 aa  353  2e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0486  glycosyltransferase-like protein  55.66 
 
 
330 aa  353  2e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.518012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  57 
 
 
320 aa  351  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0102  glycosyltransferase-like protein  50 
 
 
334 aa  332  7.000000000000001e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4680  Ribonuclease III  50.65 
 
 
316 aa  325  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1089  glycosyltransferase  52.27 
 
 
318 aa  322  8e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0155785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4183  glycosyl transferase family protein  49.84 
 
 
333 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2173  glycosyl transferase family 2  45.31 
 
 
318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  44.01 
 
 
320 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.72 
 
 
323 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  40.72 
 
 
323 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  40.72 
 
 
323 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.72 
 
 
323 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  40.72 
 
 
323 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  38.19 
 
 
310 aa  242  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  41.8 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  41.8 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  40.97 
 
 
351 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  40.52 
 
 
324 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  40.13 
 
 
341 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  39.94 
 
 
312 aa  229  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  40.97 
 
 
352 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  40.78 
 
 
330 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  40.58 
 
 
330 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 
333 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.51 
 
 
319 aa  226  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3451  glycosyl transferase family 2  39.87 
 
 
321 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0242302  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  39.94 
 
 
320 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  38.31 
 
 
343 aa  219  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  39.03 
 
 
346 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  37.18 
 
 
321 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  38.76 
 
 
331 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
319 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  39.62 
 
 
337 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  37.46 
 
 
350 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  39.03 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  38.91 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  37.94 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  39.03 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  38.91 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  39.03 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  38.71 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  39.03 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  38.39 
 
 
306 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  38.44 
 
 
336 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 
335 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
327 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  37.38 
 
 
319 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  37.34 
 
 
348 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  38.76 
 
 
306 aa  208  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  36.48 
 
 
335 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  38.19 
 
 
308 aa  208  9e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  37.46 
 
 
330 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  37.13 
 
 
330 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  36.39 
 
 
339 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  37.74 
 
 
306 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  37.54 
 
 
334 aa  205  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
347 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 
312 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  38.51 
 
 
327 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
312 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  38.97 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  37.69 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  37.42 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  37.34 
 
 
334 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  37.34 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.52 
 
 
332 aa  199  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  34.95 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  37.5 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  37.27 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
319 aa  195  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
312 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25741  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
324 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.25 
 
 
353 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.25 
 
 
353 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.25 
 
 
353 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  35.71 
 
 
312 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.2 
 
 
308 aa  192  7e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  35.6 
 
 
353 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
312 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  33.98 
 
 
319 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  37.22 
 
 
350 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
360 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 
322 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2952  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 
305 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23402  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 
357 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 
345 aa  188  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 
339 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>