More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3451 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3451  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
321 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0242302  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1941  Ribonuclease III  39.75 
 
 
343 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4183  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 
333 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  39.35 
 
 
320 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  37.78 
 
 
323 aa  225  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2344  glycosyl transferase family 2  39.87 
 
 
340 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
324 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.78 
 
 
323 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  37.78 
 
 
323 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.78 
 
 
323 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  37.78 
 
 
323 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  38.36 
 
 
312 aa  222  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  36.39 
 
 
310 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  40.06 
 
 
346 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  40.97 
 
 
351 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 
364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  40.38 
 
 
341 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.16 
 
 
319 aa  218  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 
333 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  40.65 
 
 
327 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  40 
 
 
330 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  40.33 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0218  glycosyltransferase-like protein  37.14 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0486  glycosyltransferase-like protein  36.83 
 
 
330 aa  216  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.518012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  38.87 
 
 
343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 
339 aa  215  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 
312 aa  215  9e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  40.13 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  41.32 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  41.61 
 
 
366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  43.32 
 
 
367 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0387  Ribonuclease III  37.38 
 
 
315 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  40.25 
 
 
357 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 
342 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  39.68 
 
 
350 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  41.04 
 
 
320 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  39.34 
 
 
311 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3180  glycosyl transferase family 2  39.67 
 
 
329 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
319 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  39.34 
 
 
311 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  42.3 
 
 
340 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  42.02 
 
 
347 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  42.43 
 
 
337 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 
322 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  37.3 
 
 
319 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  39.94 
 
 
334 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 
338 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  38.41 
 
 
331 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  36.66 
 
 
319 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1089  glycosyltransferase  37.58 
 
 
318 aa  205  7e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0155785  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  39.93 
 
 
320 aa  205  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  38.73 
 
 
319 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0102  glycosyltransferase-like protein  34.73 
 
 
334 aa  202  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
330 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  36.81 
 
 
330 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4680  Ribonuclease III  36.22 
 
 
316 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
312 aa  202  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
341 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  37.95 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  37.91 
 
 
353 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  41.5 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  43.65 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  35.26 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  43.65 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  39.23 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  35.58 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.58 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.58 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.58 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 
356 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  40.45 
 
 
334 aa  195  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  35.58 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
309 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  35.26 
 
 
308 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 
365 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  38.16 
 
 
365 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 
365 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.59 
 
 
332 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  40.06 
 
 
339 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  35.78 
 
 
306 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  40.71 
 
 
339 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  35.29 
 
 
310 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  34.97 
 
 
310 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 
327 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  36.04 
 
 
306 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  34.97 
 
 
312 aa  189  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 
319 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 
334 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  34.73 
 
 
314 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  39.87 
 
 
348 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2173  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 
318 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  34.85 
 
 
308 aa  186  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  35.39 
 
 
306 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2381  glycosyltransferase, group 2 family protein  35.83 
 
 
313 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  38.41 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>