More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3500 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  100 
 
 
365 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  99.18 
 
 
365 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  99.18 
 
 
365 aa  729    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  83.38 
 
 
359 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  80.97 
 
 
358 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  81.25 
 
 
358 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  70.4 
 
 
353 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  70.4 
 
 
353 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  71.52 
 
 
353 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  70.4 
 
 
353 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  70.9 
 
 
347 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  70.59 
 
 
347 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  69.23 
 
 
347 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  70.59 
 
 
347 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  70.59 
 
 
347 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  65.28 
 
 
348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  66.78 
 
 
357 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  65.69 
 
 
340 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  65.36 
 
 
338 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  62.54 
 
 
360 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  66.88 
 
 
337 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  57.38 
 
 
319 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  54.78 
 
 
340 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  54.49 
 
 
327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  55.81 
 
 
347 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  53.31 
 
 
306 aa  347  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  50.62 
 
 
330 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  50.62 
 
 
330 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  52.79 
 
 
308 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  53.14 
 
 
306 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  52.79 
 
 
308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  52.46 
 
 
308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  53.14 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  52.3 
 
 
335 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  52.81 
 
 
310 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  49.84 
 
 
334 aa  339  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  52.82 
 
 
306 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  49.84 
 
 
320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  52.75 
 
 
350 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  50.5 
 
 
319 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  51.68 
 
 
312 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  48.85 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  49.68 
 
 
334 aa  316  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  52.15 
 
 
309 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4458  bactoprenol glucosyl transferase  52.15 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4543  bactoprenol glucosyl transferase  52.15 
 
 
309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  50.46 
 
 
342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  48.48 
 
 
383 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0642  putative glycosyl transferase  49.18 
 
 
304 aa  300  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  43.47 
 
 
346 aa  295  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  44.54 
 
 
367 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  47.25 
 
 
337 aa  291  8e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  47 
 
 
339 aa  290  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  47.25 
 
 
383 aa  289  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  46.13 
 
 
348 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  43.6 
 
 
343 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 
332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  47.54 
 
 
336 aa  282  7.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.61 
 
 
332 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  43.85 
 
 
339 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  44.71 
 
 
335 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  45.39 
 
 
311 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 
307 aa  276  5e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  45.39 
 
 
311 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  46.65 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0162  putative glycosyl transferase family protein  48.69 
 
 
316 aa  272  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  47.67 
 
 
373 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  47.67 
 
 
373 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 
339 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  40.33 
 
 
310 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 
345 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 
334 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 
312 aa  269  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  42.17 
 
 
324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  47.19 
 
 
339 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.85 
 
 
324 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  47.7 
 
 
324 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  41.91 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  43.56 
 
 
312 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  46 
 
 
343 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  42.9 
 
 
330 aa  265  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 
341 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  42.24 
 
 
330 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 
366 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 
362 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  47.37 
 
 
324 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 
341 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  42.55 
 
 
331 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 
364 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  43.57 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 
324 aa  258  9e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  44.22 
 
 
312 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  44.76 
 
 
334 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.02 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.34 
 
 
308 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.02 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  38.02 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  38.02 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  37.7 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  38.56 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>