More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1089 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1089  glycosyltransferase  100 
 
 
318 aa  654    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0155785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0387  Ribonuclease III  51.89 
 
 
315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3180  glycosyl transferase family 2  53.04 
 
 
329 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1941  Ribonuclease III  50.96 
 
 
343 aa  328  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4680  Ribonuclease III  52.08 
 
 
316 aa  322  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2344  glycosyl transferase family 2  52.27 
 
 
340 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0102  glycosyltransferase-like protein  52.09 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0218  glycosyltransferase-like protein  52.43 
 
 
330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0486  glycosyltransferase-like protein  52.43 
 
 
330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.518012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  47.47 
 
 
320 aa  308  8e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4183  glycosyl transferase family protein  47.57 
 
 
333 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2173  glycosyl transferase family 2  45.4 
 
 
318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  42.44 
 
 
311 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  42.44 
 
 
311 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  43.37 
 
 
350 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  42.04 
 
 
333 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.13 
 
 
323 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  40.13 
 
 
323 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.13 
 
 
323 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  40.13 
 
 
323 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  40.13 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  40.25 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 
320 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  38.54 
 
 
321 aa  228  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  38.31 
 
 
335 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  39.68 
 
 
343 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 
352 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  40.13 
 
 
351 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  40.26 
 
 
330 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 
319 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 
334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  36.66 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  39.3 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  38.31 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  36.31 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.66 
 
 
319 aa  212  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  37.99 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  37.99 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  37.79 
 
 
306 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  38.11 
 
 
310 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
324 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  38.11 
 
 
310 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  37.66 
 
 
308 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  37.38 
 
 
350 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  37.22 
 
 
367 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  37.99 
 
 
320 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
338 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
340 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  38.59 
 
 
346 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  38.64 
 
 
306 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3451  glycosyl transferase family 2  37.58 
 
 
321 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0242302  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  35.99 
 
 
312 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
339 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  37.13 
 
 
306 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  39.55 
 
 
345 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  40.78 
 
 
353 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
341 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.32 
 
 
353 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.32 
 
 
353 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.32 
 
 
353 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
309 aa  202  7e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 
340 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
383 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 
360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  39.11 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
319 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  37.18 
 
 
319 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
347 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  36.01 
 
 
337 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  36.54 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  35.92 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  36.51 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 
334 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  41.48 
 
 
337 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  36.27 
 
 
320 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 
347 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
387 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  35.9 
 
 
319 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  35.6 
 
 
336 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
331 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  36.51 
 
 
373 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
373 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  36.31 
 
 
308 aa  193  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 
347 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 
347 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  35.37 
 
 
358 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
365 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
365 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  35.83 
 
 
365 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  34.73 
 
 
312 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
358 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.22 
 
 
332 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
341 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 
348 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
356 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  40.26 
 
 
347 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  40.26 
 
 
347 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>