More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0123 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  100 
 
 		 350 aa  704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  49.51 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  48.38 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  47.39 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  44.41 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.12 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.12 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  44.12 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  43.79 
 
 		 323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  44.12 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  42.57 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  46.28 
 
 		 330 aa  281  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  46.6 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  46.2 
 
 		 312 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  43.18 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  46.69 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  47.87 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  47.04 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  47.04 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  45.75 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.28 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  43.28 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  44.65 
 
 		 364 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  43.67 
 
 		 324 aa  269  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  42.9 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  43.18 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  42.07 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  42.19 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  43.09 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  45.4 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  45.4 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  44.88 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  44.88 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 		 309 aa  255  9e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  43.81 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  43.33 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  40.06 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  40.58 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  39.53 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  41.42 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 		 334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  40.2 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  40.07 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  40.84 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 		 338 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0387  Ribonuclease III  40.26 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.95 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  37.13 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  40.85 
 
 		 353 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  39.23 
 
 		 348 aa  229  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  38.64 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  39.8 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.93 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.93 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.93 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  38.51 
 
 		 319 aa  225  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  37.99 
 
 		 314 aa  225  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  38.51 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  36.42 
 
 		 343 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  39.55 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0218  glycosyltransferase-like protein  38.06 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0486  glycosyltransferase-like protein  38.06 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.518012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  38.06 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  36.84 
 
 		 308 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2952  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  40.92 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  36.81 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  38.16 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 		 312 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  37.09 
 
 		 310 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  39.54 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  37.09 
 
 		 310 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2381  glycosyltransferase, group 2 family protein  37.93 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  38.96 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 		 358 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  36.51 
 
 		 308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3180  glycosyl transferase family 2  39.16 
 
 		 329 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  36.75 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  37.95 
 
 		 306 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1089  glycosyltransferase  38.34 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0155785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  36.18 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  39.6 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>