More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4183 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4183  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 333 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  52.35 
 
 		 320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0218  glycosyltransferase-like protein  50.78 
 
 		 330 aa  325  4.0000000000000003e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0486  glycosyltransferase-like protein  50.78 
 
 		 330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.518012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3180  glycosyl transferase family 2  51.79 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2344  glycosyl transferase family 2  49.84 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1941  Ribonuclease III  47.88 
 
 		 343 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0387  Ribonuclease III  45.69 
 
 		 315 aa  291  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4680  Ribonuclease III  47.9 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0102  glycosyltransferase-like protein  45.37 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1089  glycosyltransferase  47.57 
 
 		 318 aa  288  8e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0155785  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2173  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  43.08 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  42.68 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  40.58 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  40.32 
 
 		 309 aa  229  7e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  38.69 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3451  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0242302  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  38.98 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  37.8 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  39.51 
 
 		 367 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  41.4 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.08 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  35.08 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.08 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  35.08 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  35.08 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 		 340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  39.68 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  41.29 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  39.14 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  40.39 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  37.66 
 
 		 308 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  40.79 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  37.66 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  37.66 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  36.59 
 
 		 312 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  36.98 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  36.98 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  36.98 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  39.1 
 
 		 320 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  38.29 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  38.29 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  35.13 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  37.01 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  37.82 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  36.36 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  38.19 
 
 		 357 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  35.69 
 
 		 348 aa  205  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  35.41 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  37.94 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.58 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 		 340 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  37.54 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.22 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.22 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.22 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  38.08 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  33.96 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  40.06 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  38.03 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  34.97 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  35.06 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  35.48 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4543  bactoprenol glucosyl transferase  35.48 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4458  bactoprenol glucosyl transferase  35.48 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  36.66 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  33.97 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 		 387 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 360 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.69 
 
 		 324 aa  192  8e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.66 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  35.08 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  38.96 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  38.96 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>