More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1860 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  94.69 
 
 
341 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  96.81 
 
 
340 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  99.71 
 
 
345 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
345 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  94.2 
 
 
344 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
345 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  94.49 
 
 
344 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  86.96 
 
 
335 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  86.96 
 
 
335 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  86.96 
 
 
335 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  86.67 
 
 
335 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  86.96 
 
 
335 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  86.96 
 
 
335 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  86.96 
 
 
335 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  86.67 
 
 
335 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  86.73 
 
 
349 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  90.03 
 
 
350 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  89.68 
 
 
347 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  77.23 
 
 
332 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  75.54 
 
 
331 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  75.54 
 
 
331 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4590  Undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  72.76 
 
 
333 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00472889  decreased coverage  0.00198336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3976  glycosyl transferase family protein  76.07 
 
 
325 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  68.49 
 
 
320 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  66.67 
 
 
320 aa  448  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  58.16 
 
 
310 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  56.87 
 
 
314 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  58.9 
 
 
312 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  55.92 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  58.09 
 
 
312 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  58.94 
 
 
312 aa  345  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.63 
 
 
322 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  51.63 
 
 
322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  51.63 
 
 
322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.63 
 
 
322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  51.63 
 
 
322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.63 
 
 
322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.63 
 
 
322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.31 
 
 
322 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.43 
 
 
326 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.98 
 
 
327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.98 
 
 
327 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.98 
 
 
327 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.98 
 
 
327 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.98 
 
 
327 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  50.98 
 
 
326 aa  308  9e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.62 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.79 
 
 
327 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.47 
 
 
327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  50.98 
 
 
327 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 
340 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0925  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.33 
 
 
331 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.937263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  48.4 
 
 
337 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  50 
 
 
339 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  49.69 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.31 
 
 
327 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.49 
 
 
327 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3616  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 
312 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.874932  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
320 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
324 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  35.76 
 
 
330 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
330 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
364 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
321 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
320 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
342 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
320 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
337 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.03 
 
 
320 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  39.03 
 
 
320 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
350 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
320 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
320 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
320 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 
320 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
314 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  37.13 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  37.82 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  33.01 
 
 
330 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
319 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  32.62 
 
 
330 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
341 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
360 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  40.26 
 
 
339 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
324 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  36.81 
 
 
336 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  33.44 
 
 
343 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  31.7 
 
 
346 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  35.24 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 
320 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.69 
 
 
316 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
334 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>