More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1592 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  100 
 
 
339 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  97.57 
 
 
339 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  78.48 
 
 
337 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  74.55 
 
 
340 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  66.88 
 
 
326 aa  451  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  67.82 
 
 
326 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  66.88 
 
 
327 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  66.56 
 
 
327 aa  448  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  64.54 
 
 
322 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  64.22 
 
 
322 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  64.22 
 
 
322 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  64.22 
 
 
322 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  63.9 
 
 
322 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  64.22 
 
 
322 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  64.22 
 
 
322 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  64.35 
 
 
327 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  64.22 
 
 
322 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  64.04 
 
 
327 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  65.05 
 
 
327 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  64.04 
 
 
327 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  64.04 
 
 
327 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  66.35 
 
 
327 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  68.27 
 
 
327 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0925  glycosyl transferase, group 2 family protein  66.88 
 
 
331 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.937263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  67.52 
 
 
327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  67.85 
 
 
327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  51.17 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  52.49 
 
 
312 aa  308  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  52.41 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  52.13 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  51.8 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  51.79 
 
 
347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  51.79 
 
 
350 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  51.48 
 
 
341 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 
340 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  51.6 
 
 
332 aa  299  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 
345 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 
345 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 
345 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.12 
 
 
335 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.12 
 
 
335 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.12 
 
 
335 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.12 
 
 
335 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.12 
 
 
335 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.12 
 
 
335 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.12 
 
 
335 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.12 
 
 
335 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  50.62 
 
 
331 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  49.69 
 
 
331 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  49.84 
 
 
349 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  51.32 
 
 
312 aa  291  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4590  Undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  47.87 
 
 
333 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00472889  decreased coverage  0.00198336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  49.02 
 
 
314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  48.87 
 
 
320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  46.95 
 
 
312 aa  280  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3976  glycosyl transferase family protein  50.79 
 
 
325 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  48.06 
 
 
320 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 
321 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
324 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
342 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  39.81 
 
 
320 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  39.49 
 
 
320 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  39.88 
 
 
320 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 
325 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3616  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 
312 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.874932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 
336 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
314 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 
319 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  37.99 
 
 
314 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.09 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  43.45 
 
 
339 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
320 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
320 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  40.51 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  39.44 
 
 
337 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  37.24 
 
 
343 aa  196  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 
343 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
324 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  39.87 
 
 
329 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
368 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 
335 aa  193  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 
316 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  36.98 
 
 
336 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  36.98 
 
 
336 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 
320 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
319 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.2 
 
 
320 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
334 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 
314 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
318 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 
343 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
568 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  37.21 
 
 
330 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>