More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1257 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
331 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  99.7 
 
 
331 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  92.47 
 
 
332 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  80.19 
 
 
350 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  80.13 
 
 
347 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  81.05 
 
 
335 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  81.05 
 
 
335 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  81.05 
 
 
335 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  81.05 
 
 
335 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  80.78 
 
 
335 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  81.05 
 
 
335 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  81.05 
 
 
335 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  79.87 
 
 
341 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  81.05 
 
 
335 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  78.25 
 
 
349 aa  517  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  75.54 
 
 
340 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  78.57 
 
 
344 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  78.57 
 
 
344 aa  517  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  75.54 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  75.54 
 
 
345 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  75.54 
 
 
345 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4590  Undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  74.13 
 
 
333 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00472889  decreased coverage  0.00198336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  73.4 
 
 
320 aa  481  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  72.76 
 
 
320 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3976  glycosyl transferase family protein  74.61 
 
 
325 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  61.69 
 
 
314 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  59.66 
 
 
310 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  59.39 
 
 
312 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  57.19 
 
 
312 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  60.66 
 
 
312 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  60.33 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  51.12 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  51.12 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.12 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.12 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.12 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  51.12 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.12 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.8 
 
 
322 aa  319  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.77 
 
 
326 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  52.13 
 
 
326 aa  315  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50 
 
 
327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.46 
 
 
327 aa  312  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.49 
 
 
327 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.49 
 
 
327 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.16 
 
 
327 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.49 
 
 
327 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  51.8 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.98 
 
 
327 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.65 
 
 
327 aa  299  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0925  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.98 
 
 
331 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.937263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  48.71 
 
 
337 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  48.87 
 
 
340 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  50.97 
 
 
339 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.24 
 
 
327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  49.69 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.13 
 
 
327 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3616  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.874932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  36.88 
 
 
335 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  35.67 
 
 
324 aa  205  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
330 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
330 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  33.64 
 
 
346 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  34.77 
 
 
312 aa  199  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  38.44 
 
 
364 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
320 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  39.12 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  35.14 
 
 
343 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 
319 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
341 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
324 aa  192  6e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  38.73 
 
 
320 aa  192  8e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
327 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 
312 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  38.07 
 
 
343 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
343 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
320 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
360 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
314 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
334 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  42.26 
 
 
339 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 
321 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  34.49 
 
 
339 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 
321 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
342 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  33.75 
 
 
323 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.3 
 
 
320 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  35.53 
 
 
330 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
320 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  34.97 
 
 
330 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.44 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  33.44 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  33.44 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  36.24 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>