More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  100 
 
 		 296 aa  584  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  66.33 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  58.84 
 
 		 331 aa  310  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  44.56 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  46.45 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  45.96 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  45.77 
 
 		 287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  45.77 
 
 		 287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  45.74 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.77 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.77 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.77 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.77 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.77 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.77 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.57 
 
 		 295 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  40.71 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1578  glycosyl transferase family 2  50.53 
 
 		 291 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  46.83 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5448  glycosyl transferase family protein  47.27 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  40.56 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  44.65 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  44.65 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  42.76 
 
 		 290 aa  195  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  42.75 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  48.24 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 841 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  25.51 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 334 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 366 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  26.54 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  27.41 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.97 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4831  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 822 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  27 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5784  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.89 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.14 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 841 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  21.5 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 		 1075 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 584 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  22.79 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  29.91 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  26.7 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  30.85 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  21.86 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>