201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3137 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 325 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  99.08 
 
 		 325 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  94.46 
 
 		 325 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  77.54 
 
 		 325 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  57.1 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  60.99 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  59.19 
 
 		 330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  59.5 
 
 		 332 aa  352  7e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  48.94 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  48.94 
 
 		 340 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 		 320 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2373  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.88 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  38.08 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 362 aa  149  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  37.56 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.09 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  24.69 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 924 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  32.89 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 1340 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.36 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  22.69 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  20.82 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.93 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 477 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 		 450 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  27.18 
 
 		 264 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 252 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24 
 
 		 528 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 247 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  22.33 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 319 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  29.73 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 329 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.18 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  22.08 
 
 		 336 aa  49.3  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 		 624 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  35.4 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 		 703 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  23.14 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 		 585 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  26.57 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  46 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 679 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  26.14 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0426  glycosyl transferase family 2  46.3 
 
 		 260 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>