More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5644 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
307 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  95.62 
 
 
307 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  81.08 
 
 
307 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  80.78 
 
 
287 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  80.78 
 
 
287 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5448  glycosyl transferase family protein  78.31 
 
 
308 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  65.33 
 
 
315 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  65.33 
 
 
315 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  65.33 
 
 
315 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  65.33 
 
 
315 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  65.33 
 
 
315 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  65.85 
 
 
302 aa  351  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  66.07 
 
 
295 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  50.68 
 
 
291 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  48.78 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  50.17 
 
 
331 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  46.32 
 
 
296 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  51.36 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  45.82 
 
 
307 aa  221  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  45.82 
 
 
307 aa  221  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  50 
 
 
292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  45.86 
 
 
264 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
289 aa  205  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1578  glycosyl transferase family 2  49.64 
 
 
291 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  48.78 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 
290 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
324 aa  92.8  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
841 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
822 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.73 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  21.58 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
836 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4915  family 2 glycosyl transferase  23.84 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3343  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178674  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  41.88 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2531  putative glycosyltransferase  30.2 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  29.5 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  34.13 
 
 
1225 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  22.46 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 
544 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.19 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
1120 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
340 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  26.79 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
454 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.34 
 
 
838 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
333 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
421 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
346 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  40.68 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.88 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
401 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
358 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.67 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  23.01 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.41 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  40 
 
 
672 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  23.96 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 
1035 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
235 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>