More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  100 
 
 
264 aa  527  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  58.8 
 
 
292 aa  241  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1578  glycosyl transferase family 2  54.14 
 
 
291 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  47.55 
 
 
290 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.1 
 
 
295 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.69 
 
 
302 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.69 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.69 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.69 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.69 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.69 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  45.86 
 
 
307 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  45.49 
 
 
307 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  41.2 
 
 
289 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  44.11 
 
 
331 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  43.94 
 
 
287 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  43.94 
 
 
287 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  42.75 
 
 
296 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  43.18 
 
 
307 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  51.91 
 
 
299 aa  188  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  44.49 
 
 
307 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  44.49 
 
 
307 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  41.2 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  40.67 
 
 
291 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5448  glycosyl transferase family protein  44.87 
 
 
308 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  43.49 
 
 
299 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  31.44 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
841 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  28.08 
 
 
1225 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
1340 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
317 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
358 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 
328 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
342 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3343  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178674  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
306 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
836 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
345 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2531  putative glycosyltransferase  30.86 
 
 
337 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
329 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
271 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
317 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
557 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 
298 aa  58.9  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
326 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  28.81 
 
 
292 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3864  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
337 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4915  family 2 glycosyl transferase  23.85 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
841 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
1035 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
924 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
672 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
1739 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  30.54 
 
 
323 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
334 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
340 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
315 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.37 
 
 
379 aa  56.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.11 
 
 
315 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
317 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
584 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
298 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
330 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
335 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
378 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
324 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
318 aa  55.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
822 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
337 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
454 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2359  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
487 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000227961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
308 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.28 
 
 
1099 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
430 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.01 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
597 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>