More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1578 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1578  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  58.42 
 
 
292 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  54.14 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  53.17 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  50.53 
 
 
296 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  47.93 
 
 
290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  55.17 
 
 
299 aa  225  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  54.42 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  41.34 
 
 
289 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  48.53 
 
 
307 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  48.53 
 
 
307 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.84 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.84 
 
 
302 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.84 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  49.64 
 
 
307 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.84 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.84 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.84 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.65 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  48.57 
 
 
307 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  45.3 
 
 
327 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  43.11 
 
 
291 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  45.71 
 
 
307 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5448  glycosyl transferase family protein  48.4 
 
 
308 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
302 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
841 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
836 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  24.09 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3343  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178674  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  27.18 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  29.48 
 
 
838 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  42.22 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.14 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
841 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  24.86 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
334 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  34.06 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  29.17 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
822 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  36.45 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
705 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
727 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  22.08 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  23.51 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.9 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
297 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  28.57 
 
 
1225 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
1739 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5784  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
291 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  21.63 
 
 
260 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>