More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1579 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
299 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  66.33 
 
 
296 aa  371  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  59.8 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  51.76 
 
 
307 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  51.06 
 
 
307 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  48.75 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.26 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.26 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.26 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.26 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.26 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.26 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  48.43 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  48.43 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.93 
 
 
295 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  46.88 
 
 
307 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  46.88 
 
 
307 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
291 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  50.35 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  45.02 
 
 
327 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1578  glycosyl transferase family 2  54.42 
 
 
291 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  53.9 
 
 
299 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5448  glycosyl transferase family protein  49.29 
 
 
308 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 
289 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  43.49 
 
 
264 aa  188  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  42.5 
 
 
290 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  23.03 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2531  putative glycosyltransferase  31.56 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3864  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
841 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3343  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178674  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
401 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
305 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  27.95 
 
 
292 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
584 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4915  family 2 glycosyl transferase  23.11 
 
 
297 aa  58.9  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  44.68 
 
 
317 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  30.4 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  21.69 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1005  glycosyl transferase family 2  38.76 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  40.71 
 
 
525 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  21.69 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
480 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  34.23 
 
 
1225 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  30.45 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.08 
 
 
311 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1832  glycosyl transferase family protein  39.52 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.52931  hitchhiker  0.00130568 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 
597 aa  56.2  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5180  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1841  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 
306 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
334 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4436  glycosyl transferase family 2  44.68 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3732  glycosyltransferase-like protein  28.83 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  0.0274925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
378 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8598  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.740895  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
379 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0345  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0405304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
287 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  22.62 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
328 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>