More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2531 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2531  putative glycosyltransferase  100 
 
 
337 aa  674    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3864  glycosyl transferase family 2  81.63 
 
 
288 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  70.95 
 
 
317 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  64.16 
 
 
293 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  62.46 
 
 
292 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3732  glycosyltransferase-like protein  50 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  0.0274925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3343  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
318 aa  92.8  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178674  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.83 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  28.89 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
841 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0072  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
282 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 
822 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  22.64 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0602  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.41 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000299087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24.04 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
337 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  31.87 
 
 
292 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
350 aa  62.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  23.83 
 
 
838 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.26 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  29.72 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
513 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.4 
 
 
754 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  23.9 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  26.58 
 
 
348 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.15 
 
 
358 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
721 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1306  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  30.86 
 
 
264 aa  59.7  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1323  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
281 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
303 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  29.05 
 
 
561 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  43.21 
 
 
1562 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1342  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.8 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  28.05 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 
528 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  20.95 
 
 
298 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  21.69 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
1250 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  27.62 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
617 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.66 
 
 
1644 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  20.48 
 
 
652 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.66 
 
 
1644 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
235 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  26.05 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
748 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
307 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0722  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
472 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.693159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
327 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
430 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
1267 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.53 
 
 
322 aa  55.8  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>