More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3594 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
290 aa  563  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  47.55 
 
 
264 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  42.07 
 
 
289 aa  208  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1578  glycosyl transferase family 2  47.93 
 
 
291 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  42.76 
 
 
296 aa  195  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  47.44 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  42.4 
 
 
331 aa  178  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  40.29 
 
 
327 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  41.48 
 
 
307 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  41.48 
 
 
307 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  52.15 
 
 
299 aa  175  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
291 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.21 
 
 
295 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.21 
 
 
302 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.21 
 
 
315 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.21 
 
 
315 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.21 
 
 
315 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.21 
 
 
315 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.21 
 
 
315 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
307 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  38.85 
 
 
307 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  40.58 
 
 
307 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  40.8 
 
 
287 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  40.8 
 
 
287 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  42.5 
 
 
299 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5448  glycosyl transferase family protein  43.01 
 
 
308 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
836 aa  76.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  21.84 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
1035 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.46 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  27.36 
 
 
1225 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3343  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178674  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
337 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
841 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
308 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
619 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
303 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
334 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  27.86 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
286 aa  63.2  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
331 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3864  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  31.68 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4915  family 2 glycosyl transferase  25.26 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
822 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
1739 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
334 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
313 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
337 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.17 
 
 
325 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
841 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
336 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  23.69 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
705 aa  59.3  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 
320 aa  58.9  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
282 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
318 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
317 aa  58.9  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
489 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.64 
 
 
838 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.15 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
304 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2531  putative glycosyltransferase  31.89 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>