174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2908 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
325 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  77.54 
 
 
325 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  77.54 
 
 
325 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  78.15 
 
 
325 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  57.41 
 
 
334 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  60.56 
 
 
332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  59.82 
 
 
330 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  57.94 
 
 
328 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  46.99 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  46.99 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  45.06 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2373  glycosyl transferase family protein  44.01 
 
 
329 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20536  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.58 
 
 
338 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  41.25 
 
 
327 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  40.42 
 
 
327 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  37.71 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
362 aa  146  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
362 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.74 
 
 
369 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  26.21 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
329 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
348 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  25.64 
 
 
264 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
318 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
336 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
307 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
1340 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  22.32 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  40 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  29.46 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  22.03 
 
 
336 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.51 
 
 
236 aa  50.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
477 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
268 aa  49.3  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
291 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  38.81 
 
 
363 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
345 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
487 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  35.71 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
257 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0991  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 
493 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.93 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2559  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 
754 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
703 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  25.93 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2550  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
350 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.930398  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  48.08 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
924 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
290 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  47.17 
 
 
255 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
640 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
329 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
377 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 
324 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
335 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3656  glycosyl transferase family 2  44 
 
 
366 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306407 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4733  glycosyl transferase family 2  44 
 
 
366 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2590  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
258 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  47.5 
 
 
255 aa  46.2  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
307 aa  45.8  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  33.61 
 
 
427 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  22.36 
 
 
310 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>