More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1703 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
353 aa  734    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  66.86 
 
 
362 aa  494  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  60.35 
 
 
362 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.69 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.85 
 
 
338 aa  186  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  40.93 
 
 
327 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  40.51 
 
 
327 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
334 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  40.09 
 
 
340 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
332 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  37.71 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  37.56 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.56 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  38.01 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 
320 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2373  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20536  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
477 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.04 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.05 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
236 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
232 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
337 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
345 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
357 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
722 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  21.07 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  27.96 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 
1101 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
433 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
312 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
346 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  28.79 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
329 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
348 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.97 
 
 
326 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  23.3 
 
 
397 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  32.14 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  23.53 
 
 
752 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  28.18 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  26.03 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
235 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 
260 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.15 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
1435 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.14 
 
 
461 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
355 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
509 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
321 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  27.43 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
310 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
324 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
924 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
398 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
335 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
268 aa  56.2  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1657  glycosyl transferase family 2  22.12 
 
 
732 aa  56.2  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0588308  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.69 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.47 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  26.2 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.47 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.47 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  24.39 
 
 
520 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.47 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.47 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.39 
 
 
505 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.47 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.47 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>