More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2078 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
255 aa  524  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  81.6 
 
 
253 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  80.8 
 
 
253 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  74.39 
 
 
250 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  74.39 
 
 
250 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  74.39 
 
 
250 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  74.39 
 
 
250 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  74.59 
 
 
254 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  74.8 
 
 
250 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  74.59 
 
 
254 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  74.18 
 
 
254 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  74.8 
 
 
250 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  74.18 
 
 
254 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  74.18 
 
 
254 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  74.18 
 
 
254 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  74.18 
 
 
254 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  75.3 
 
 
254 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  55.87 
 
 
255 aa  284  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  55 
 
 
256 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  52.21 
 
 
253 aa  268  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  53.14 
 
 
260 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  51.41 
 
 
253 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  52.05 
 
 
263 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  50 
 
 
256 aa  230  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  48 
 
 
257 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  48 
 
 
257 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  44.94 
 
 
257 aa  218  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  40.32 
 
 
258 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  44 
 
 
257 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  43.02 
 
 
259 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  42.23 
 
 
260 aa  198  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  42.23 
 
 
260 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.23 
 
 
260 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  41.25 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  45.08 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.06 
 
 
260 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  41.73 
 
 
263 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  42.15 
 
 
249 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  40 
 
 
256 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  41.27 
 
 
259 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  41.63 
 
 
256 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 
257 aa  184  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  40.87 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.46 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  39.52 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  39.68 
 
 
260 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  39.68 
 
 
260 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  39.11 
 
 
267 aa  182  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  37.4 
 
 
259 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  36.14 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  36.95 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.98 
 
 
516 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  35.08 
 
 
254 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.08 
 
 
254 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
257 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.98 
 
 
515 aa  168  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  38.46 
 
 
249 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2110  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
255 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202375  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  40.98 
 
 
269 aa  165  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  38.58 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  31.78 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  34.03 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  35.71 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.44 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 
254 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  38.55 
 
 
270 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
257 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 
241 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2921  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 
263 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.417416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.37 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.06 
 
 
252 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  31.64 
 
 
515 aa  153  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  36.99 
 
 
249 aa  152  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
280 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1130  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.73 
 
 
256 aa  151  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0782775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3225  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
261 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0586  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
249 aa  148  9e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  39.15 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
261 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
521 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
288 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
252 aa  145  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3579  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 
272 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28408  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
249 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  32.52 
 
 
254 aa  141  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
535 aa  139  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1425  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 
310 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1454  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 
310 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3434  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
309 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134306  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2546  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 
279 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4532  family 2 glycosyl transferase  31.67 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2126  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
277 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3875  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
313 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0296583  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1166  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.57 
 
 
297 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  34.96 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>