More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2880 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
331 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  69.02 
 
 
332 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  61.52 
 
 
331 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  45.02 
 
 
348 aa  279  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  43.9 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  37.81 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  35.26 
 
 
332 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 
329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 
329 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 
341 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
357 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.74 
 
 
1099 aa  84  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.21 
 
 
927 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.57 
 
 
1115 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 
1101 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.62 
 
 
1115 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.62 
 
 
1119 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 
1115 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.88 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.77 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
1120 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.94 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.54 
 
 
872 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  29.01 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.3 
 
 
421 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  23.66 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 
414 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  27.3 
 
 
421 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
420 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.37 
 
 
1115 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.34 
 
 
369 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  35.04 
 
 
694 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  26.13 
 
 
822 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 
752 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.7 
 
 
380 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  29.28 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.14 
 
 
461 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 
457 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  28.93 
 
 
442 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
313 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  38.46 
 
 
243 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  38.79 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
785 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  27.14 
 
 
442 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  27.64 
 
 
425 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  27.64 
 
 
425 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
1032 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  38 
 
 
254 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  27.31 
 
 
442 aa  57  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 
350 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
312 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
271 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
311 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.24 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
235 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
509 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 
1124 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
279 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  26.34 
 
 
424 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  39.62 
 
 
410 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
292 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1810  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
513 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0885657  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  25.13 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  29.76 
 
 
423 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
441 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  26.26 
 
 
441 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.75 
 
 
789 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>