114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1005 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
328 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  60.87 
 
 
325 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  60.99 
 
 
325 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  60.25 
 
 
325 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  57.94 
 
 
325 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  53.87 
 
 
334 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  58.33 
 
 
332 aa  342  7e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  53.33 
 
 
330 aa  311  7.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  45.59 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  45.9 
 
 
340 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  42.55 
 
 
320 aa  235  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2373  glycosyl transferase family protein  41.69 
 
 
329 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20536  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.39 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 
327 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  41.77 
 
 
327 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
362 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
362 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.4 
 
 
369 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  36.78 
 
 
353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  27.92 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
450 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  26.1 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 
317 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  21.94 
 
 
337 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  28.5 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  28.28 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
924 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
290 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  22.59 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.03 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 
400 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  21.93 
 
 
338 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
329 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  24.76 
 
 
315 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  26.4 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
1340 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
477 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  20 
 
 
528 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
624 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
258 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  27.18 
 
 
299 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
258 aa  46.6  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
470 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
289 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
268 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
290 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
235 aa  45.8  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  40 
 
 
400 aa  45.8  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
240 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  39.33 
 
 
427 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
679 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  43.64 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  38.46 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 
470 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  24.92 
 
 
470 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
1120 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  38.46 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
260 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
640 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.75 
 
 
255 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  29.68 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  22.01 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  21.82 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  44.07 
 
 
255 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
282 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
322 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.47 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  30.47 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
255 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
485 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
485 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>