More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1887 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 360 aa  727    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  49.09 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  48.05 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  46.34 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  43.9 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  35.24 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  35.67 
 
 		 329 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 357 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  39.78 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  29.27 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 1002 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  24.44 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 902 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  24.5 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 1035 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 1120 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  31.01 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.77 
 
 		 927 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  25.34 
 
 		 700 aa  56.2  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  21.86 
 
 		 841 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.38 
 
 		 872 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  27.75 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3775  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0748146  normal  0.865798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.81 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  26.13 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0274  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 294 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  26.13 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1591  family 2 glycosyl transferase  30.92 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3040  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.679384  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.17 
 
 		 1115 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.17 
 
 		 1115 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.91 
 
 		 1099 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.43 
 
 		 1119 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 314 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.9 
 
 		 413 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 303 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  30.3 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  33.98 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 477 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  26.15 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 1162 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 		 1115 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.26 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.94 
 
 		 1101 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  22.43 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 317 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 703 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>