More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3775 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3775  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
311 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0748146  normal  0.865798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  74.92 
 
 
298 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  73.67 
 
 
305 aa  455  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  76.98 
 
 
305 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1368  glycosyl transferase, family 2  73.01 
 
 
309 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  70.71 
 
 
306 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  72.32 
 
 
327 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  69.15 
 
 
298 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  70.79 
 
 
324 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  62.71 
 
 
314 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  63.97 
 
 
364 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
336 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.94 
 
 
301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
285 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  32.53 
 
 
291 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
311 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
314 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
343 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
343 aa  99.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
319 aa  95.9  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
420 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
324 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
414 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
273 aa  89  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
411 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
344 aa  87  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  23.78 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
480 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  28.15 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.07 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  23.22 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  28.28 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
394 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.28 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.28 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.28 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.28 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.28 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.28 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.28 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
330 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.28 
 
 
335 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  28.74 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.17 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
231 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
252 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  30.7 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>