More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2523 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  100 
 
 
305 aa  624  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  71.48 
 
 
298 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  70.45 
 
 
327 aa  435  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1368  glycosyl transferase, family 2  68.21 
 
 
309 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  69.49 
 
 
306 aa  435  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3775  glycosyl transferase family 2  73.67 
 
 
311 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0748146  normal  0.865798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  71 
 
 
305 aa  431  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  70.24 
 
 
298 aa  425  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  67.81 
 
 
324 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  62.54 
 
 
364 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  61.86 
 
 
314 aa  387  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 
336 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.06 
 
 
301 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
285 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 
295 aa  128  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
311 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
299 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
305 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
314 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
343 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
343 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
420 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
273 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
414 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  28.2 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
411 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
298 aa  94  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
272 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
319 aa  92.4  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 
368 aa  89.7  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.9 
 
 
384 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
248 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
394 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
230 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
230 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
344 aa  86.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
331 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
394 aa  85.9  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
344 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
336 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  26.4 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  33.33 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
227 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.59 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  27.12 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.33 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  27.69 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
335 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
335 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.69 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.69 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.57 
 
 
335 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
335 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.57 
 
 
335 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.57 
 
 
335 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  27.69 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.05 
 
 
320 aa  79  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
345 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.69 
 
 
322 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
345 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
312 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
345 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.57 
 
 
335 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
320 aa  79  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  27.65 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.69 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>