More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3970 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
252 aa  518  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  91.13 
 
 
266 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0825  glycosyl transferase family 2  56.38 
 
 
251 aa  281  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
230 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
263 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  32.88 
 
 
236 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1339  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
265 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193508  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1303  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
265 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1320  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
265 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
227 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
298 aa  99  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.75 
 
 
864 aa  98.6  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
411 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.05 
 
 
248 aa  98.6  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  30.7 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
298 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
344 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.88 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.88 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.88 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.61 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
305 aa  95.5  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  30.97 
 
 
313 aa  95.5  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
432 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3413  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  30.25 
 
 
305 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.8 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
430 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
327 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.36 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
304 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1143  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
245 aa  92.8  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.290738  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
319 aa  92.4  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
312 aa  92  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
227 aa  91.7  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
324 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.09 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
331 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.78 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32856  predicted protein  33.18 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
386 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
314 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.73 
 
 
384 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.34 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  30.59 
 
 
244 aa  89  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
319 aa  89  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
340 aa  89  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
336 aa  88.6  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2157  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.05 
 
 
386 aa  88.6  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
314 aa  88.6  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.4 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.57 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
331 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
337 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
235 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
337 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  33.33 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
320 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  31.48 
 
 
329 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  30.32 
 
 
298 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.97 
 
 
371 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
394 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0022  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
412 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882894  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.51 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
420 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.05 
 
 
345 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.22 
 
 
327 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  27.23 
 
 
410 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.39 
 
 
809 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3991  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
326 aa  85.9  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
230 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
414 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0778  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
414 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12213  hitchhiker  0.000342475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.71 
 
 
376 aa  85.5  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
226 aa  85.5  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.75 
 
 
241 aa  85.5  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.94 
 
 
339 aa  85.5  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  28.84 
 
 
883 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3784  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.39 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.516121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  34.88 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>