More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1130 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
266 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  91.13 
 
 
252 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0825  glycosyl transferase family 2  56.61 
 
 
251 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
284 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.99 
 
 
248 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  32.88 
 
 
236 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  30.83 
 
 
305 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.25 
 
 
265 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.25 
 
 
265 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.25 
 
 
265 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.34 
 
 
384 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.73 
 
 
864 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  30.23 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
430 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.41 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.21 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.21 
 
 
809 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
227 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  29.65 
 
 
313 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
411 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
340 aa  92.8  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  29.71 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.88 
 
 
233 aa  92.8  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.73 
 
 
376 aa  92.4  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
272 aa  92  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.74 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2157  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.52 
 
 
386 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
227 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1339  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193508  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1303  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.77 
 
 
371 aa  90.1  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1320  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3418  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.69 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187526  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  28.7 
 
 
883 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
331 aa  88.6  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
314 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.39 
 
 
339 aa  88.6  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
314 aa  88.6  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
230 aa  88.6  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.49 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.05 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  29.22 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.46 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1368  glycosyl transferase, family 2  28.75 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3413  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
344 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
432 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.8 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.45 
 
 
247 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
327 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
246 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
314 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
306 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  28.88 
 
 
412 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
386 aa  86.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32856  predicted protein  32.73 
 
 
252 aa  86.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.14 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
230 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
324 aa  85.9  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.7 
 
 
239 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
320 aa  85.5  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  28.33 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0022  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882894  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0778  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12213  hitchhiker  0.000342475 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  26.02 
 
 
410 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  29.95 
 
 
329 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.17 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1143  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.290738  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.51 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.31 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  28.45 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  31.65 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>