More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2453 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
328 aa  673    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  47.26 
 
 
311 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  47.66 
 
 
311 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 
322 aa  211  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
315 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 
322 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.24 
 
 
337 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  34.1 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.31 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
528 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
477 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
304 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
284 aa  103  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
362 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
277 aa  93.2  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  36.9 
 
 
235 aa  92.8  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.19 
 
 
369 aa  92  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.65 
 
 
312 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
924 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
247 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.18 
 
 
1644 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.18 
 
 
1644 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1040  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
242 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.852746  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 
240 aa  86.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
312 aa  85.9  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  30.68 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.54 
 
 
822 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  36.31 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.05 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
1334 aa  79.7  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  31.75 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
487 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
703 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
988 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.27 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.55 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  28.77 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  29.11 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
841 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  31.4 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
619 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
310 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  26 
 
 
731 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  29.7 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
470 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  28.57 
 
 
479 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.59 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
796 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
753 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  31.31 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
351 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>