More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1427 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
338 aa  680    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  45.57 
 
 
327 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  44.73 
 
 
327 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 
334 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  34.77 
 
 
340 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  37.82 
 
 
362 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  34.77 
 
 
340 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
362 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 
325 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.39 
 
 
325 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  37.18 
 
 
328 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  39.71 
 
 
332 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
325 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.84 
 
 
369 aa  172  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 
325 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  37.64 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2373  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 
329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20536  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
477 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
284 aa  87  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
331 aa  86.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
528 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  25.45 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.6 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
415 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.91 
 
 
236 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
324 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
232 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
441 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
341 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
240 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
233 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  41.07 
 
 
422 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
397 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  23.25 
 
 
310 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
322 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
260 aa  63.2  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
236 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
703 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
428 aa  62.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
392 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
240 aa  62.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0939  glycosyl transferase family 2  43.01 
 
 
391 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.709084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
470 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  22.6 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.18 
 
 
242 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  27.64 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
311 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  28.26 
 
 
248 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  33.04 
 
 
243 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
344 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
344 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  24.1 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.61 
 
 
1099 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  36.97 
 
 
427 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
301 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
315 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
305 aa  59.7  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
509 aa  60.1  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 
313 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
235 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
303 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>