More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4699 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
308 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
310 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
311 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  30.85 
 
 
310 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
313 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
335 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
310 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
313 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
309 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  31.69 
 
 
316 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
454 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
313 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
313 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
328 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
323 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
413 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
305 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  26.32 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
310 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
438 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  27.27 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
315 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
426 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
314 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
623 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  26.45 
 
 
1041 aa  85.9  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  29.39 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  27.21 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  28.03 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
626 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.41 
 
 
331 aa  79  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  24.82 
 
 
1065 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3187  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0795878  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
597 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3846  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
1035 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
924 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6856  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  24.8 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  31.07 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.07 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  31.07 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.07 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  27.55 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1100  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.58 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
773 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>